ciao,
se non hai speciali esigenze ext3 e' un file system molto valido e soprattutto robusto(ormai di bug ,se ci sono,sono veramente pochi) e si comporta bene in tutte le situazioni.
Ext4 e' piu' prestante,ma e' ancora in evoluzione e quindi piu' soggetto ad errori e problemi.Ultimamente Theodore Ts'o ha parlato di apportare dei cambiamenti,quindi e' un cantiere ancora aperto.Nonostante cio' google lo ha scelto come filesystem ufficiale per i suoi servers.
Poi abbiamo ReiserFs,che ti sconsiglio,visto che il principale sviluppatore e' in galera per l'assassinio della moglie e lo sviluppo mi sembra abbastanza a rilento,e l'ultima volta che l'ho provato,mi sono ritrovato la / totalmente fo...ta
Andando avanti abbiamo Xfs, un'ottimo filesystem,robusto e molto valido con file molto grandi.Ottimo quindi per montaggi video,pvr (mythtv ad esempio) e cosi' via.Soffre pero' con i file piccoli (immagini,documenti ,sorgenti di programmi,etc)
Infine c'e' jfs ,senza lode e senza infamia direi.Lo sviluppo non e' molto attivo,piu' che altro viene mantenuto per il funzionamento corretto con le release del kernel,nulla di piu'.Le prestazioni anche qui sono simili ad xfs,anche se quest'ultimo e' migliore.
In futuro potrebbe essere interessante btrfs,ma al momento è veramente un campo minato.Da usare solo se sei un sviluppatore o un pò spericolato :P
Spero di averti dato un minimo di idee sui filesystems di linux.Cerca bene anche nel forum,troverai chili di post sull'argomento .